Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mbd3Q9Z2D8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mbd3Q9Z2D8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms