Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn8Q9Z260 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms