Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfs1Q9Z1J3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfs1Q9Z1J3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfs1Q9Z1J3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms