Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi3Q9Z184 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Padi3Q9Z184 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Padi3Q9Z184 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms