Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cog1Q9Z160 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cog1Q9Z160 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms