Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1h3Q9Z0Y9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms