Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slfn1Q9Z0I7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms