Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp2Q9Z0E6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms