Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni1Q9WUZ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnni1Q9WUZ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnni1Q9WUZ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms