Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT3

Rps6ka2, Ribosomal protein S6 kinase alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka2Q9WUT3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka2Q9WUT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps6ka2Q9WUT3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka2Q9WUT3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms