Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms