Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psma4Q9R1P0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms