Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slit2Q9R1B9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slit2Q9R1B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slit2Q9R1B9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms