Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zeb2Q9R0G7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms