Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf346Q9R0B7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf346Q9R0B7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms