Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Npas3Q9QZQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms