Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn8Q9QZ49 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms