Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndrg3Q9QYF9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndrg3Q9QYF9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms