Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trip4Q9QXN3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Trip4Q9QXN3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms