Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apbb1Q9QXJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms