Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Limd1Q9QXD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Limd1Q9QXD8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms