Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc2lQ9JME7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms