Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp3a41aQ9JMA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms