Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Cabp1Q9JLK7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cabp1Q9JLK7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cabp1Q9JLK7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms