Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SacsQ9JLC8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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