Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN0

Polh, DNA polymerase eta, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolhQ9JJN0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolhQ9JJN0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PolhQ9JJN0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolhQ9JJN0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolhQ9JJN0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolhQ9JJN0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolhQ9JJN0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms