Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbr1Q9JIT0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmbr1Q9JIT0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms