Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Praf2Q9JIG8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Praf2Q9JIG8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Praf2Q9JIG8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms