Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gtf2ird1Q9JI57 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms