Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrnb2Q9ERK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrnb2Q9ERK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrnb2Q9ERK7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms