Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk4Q9ERK0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk4Q9ERK0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms