Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clstn2Q9ER65 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Clstn2Q9ER65 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms