Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capn12Q9ER56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms