Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r44Q9EQ47 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms