Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r172Q9EPS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r172Q9EPS4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r172Q9EPS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms