Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn1Q9EPL2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn1Q9EPL2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms