Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aph1cQ9DCZ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aph1cQ9DCZ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms