Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3fQ9DCH4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eif3fQ9DCH4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms