Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp27a1Q9DBG1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp27a1Q9DBG1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp27a1Q9DBG1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms