Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fundc1Q9DB70 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fundc1Q9DB70 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms