Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnpy3Q9DAU1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnpy3Q9DAU1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms