Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd8Q9DA37 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd8Q9DA37 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms