Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgf29Q9DA08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgf29Q9DA08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sgf29Q9DA08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms