Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actrt2Q9D9L5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actrt2Q9D9L5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actrt2Q9D9L5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms