Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Actrt1Q9D9J3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms