Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmco5aQ9D9D5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmco5aQ9D9D5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.1 ms