Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf2e2Q9D902 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2e2Q9D902 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms