Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm5Q9D806 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms