Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn22Q9D7U6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn22Q9D7U6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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