Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2310002L09RikQ9D7L5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
2310002L09RikQ9D7L5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2310002L09RikQ9D7L5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms